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水樣大腸桿菌檢測的方法非常的多，如多管發酵法，封膜法，但是小編推薦的是酶底物法程控定量封口機，下面來詳細的看看。

1、方法靈敏度不同。多管發酵法為每100 m  l樣品2 cfu酶底物法為每100 m  l樣品1 cfu。

2.方法步驟不同。多管發酵法是多步測定，費時費力；酶底物法是一步測定，省時省力。

3、方法花費的時間不同。多管發酵法需要在24小時內報告陰性水樣的結果，72小時內報告陽性水樣的結果。無論陰性或陽性水樣，酶底物法都能在24小時內報告結果。

4.方法費用不同。多管發酵法可以使用半成品培養基或自制培養基，檢測成本低。目前國內也在發用于初始發酵試驗的成品培養基和一次性耗材，但由于陽性水樣必須經過驗證推廣，該商用試劑的應用受到限制；酶底物法使用商業試劑，目前只有國外廠家提供，檢測成本高。這種方法在東部經濟發達地區廣泛使用。

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